وبائی مرض کے آغاز کے بعد سے، تشخیصی جانچ نے سارس-کو-2 کے پھیلاؤ کو کنٹرول کرنے میں ایک اہم کردار ادا کیا ہے، یہ وائرس جس کا سبب بنتا ہے۔COVID 19.تیز رفتار اینٹیجن ٹیسٹگھر پر یا طبی ترتیب میں انجام دیا گیا 15 منٹ یا اس سے کم وقت میں نتائج فراہم کرتے ہیں۔جتنی جلدی کسی شخص کی تشخیص ہوتی ہے، اتنی جلدی وہ طبی امداد حاصل کر سکتا ہے اور خود کو دوسروں سے الگ کر سکتا ہے۔لیکن جب وائرس کی نئی قسمیں ظاہر ہوتی ہیں، تو ان ٹیسٹوں کے ذریعے ان قسموں کا پتہ نہیں چل سکتا۔
زیادہ تر تیز اینٹیجن ٹیسٹ SARS-CoV-2 نیوکلیو کیپسڈ پروٹین یا N-پروٹین کا پتہ لگانے کے لیے بنائے گئے ہیں۔یہ پروٹین وائرل ذرات اور متاثرہ افراد میں وافر مقدار میں پایا جاتا ہے۔ریپڈ ٹیسٹ کٹs میں عام طور پر دو مختلف تشخیصی اینٹی باڈیز ہوتی ہیں جو N پروٹین کے مختلف حصوں سے منسلک ہوتی ہیں۔جب ایک اینٹی باڈی نمونے میں N پروٹین سے منسلک ہوتی ہے، تو ٹیسٹ کٹ پر رنگین لکیر یا دیگر سگنل ظاہر ہوتا ہے، جو انفیکشن کی نشاندہی کرتا ہے۔
پروٹین N 419 امینو ایسڈ ساختی اکائیوں پر مشتمل ہے۔ان میں سے کسی کو بھی میوٹیشن کے ذریعے دوسرے امینو ایسڈ سے تبدیل کیا جا سکتا ہے۔پی ایچ ڈی کی قیادت میں ریسرچ گروپایموری یونیورسٹی کے فلپ فرینک اور ایرک اورٹلنڈ اس بات کی تحقیق کرنے نکلے کہ یہ واحد امینو ایسڈ تبدیلی کس طرح تیز رفتار اینٹیجن ٹیسٹ کی کارکردگی کو متاثر کرتی ہے۔انہوں نے ایک تکنیک کا استعمال کیا جسے ڈیپ میوٹیشن اسکیننگ کہا جاتا ہے تاکہ بیک وقت یہ اندازہ لگایا جا سکے کہ وائرس کے N پروٹین میں ہر ایک تبدیلی تشخیصی اینٹی باڈی کے پابند ہونے کو کیسے متاثر کرتی ہے۔ان کے نتائج 15 ستمبر 2022 کو سیل میں شائع ہوئے۔
محققین نے تقریباً 8,000 N پروٹین میوٹیشنز کی ایک جامع لائبریری بنائی۔یہ متغیرات تمام ممکنہ تغیرات میں سے 99.5 فیصد سے زیادہ ہیں۔اس کے بعد انہوں نے اس بات کا جائزہ لیا کہ کس طرح ہر قسم نے 17 مختلف تشخیصی اینٹی باڈیز کے ساتھ تعامل کیا جو 11 تجارتی طور پر دستیاب تیز رفتار اینٹیجن ٹیسٹوں میں استعمال ہوتے ہیں، بشمول عامگھریلو کٹس.
ٹیم نے اندازہ کیا کہ کون سے N-پروٹین کی تبدیلیاں اینٹی باڈی کی شناخت کو متاثر کرتی ہیں۔اس معلومات کی بنیاد پر، انہوں نے ہر تشخیصی اینٹی باڈی کے لیے ایک "Escape mutation profile" بنایا۔یہ پروفائل N پروٹین میں مخصوص تغیرات کی نشاندہی کرتا ہے جو اینٹی باڈی کی اپنے ہدف سے منسلک ہونے کی صلاحیت کو متاثر کر سکتا ہے۔تجزیے سے معلوم ہوا کہ آج کے تیز رفتار ٹیسٹوں میں استعمال ہونے والی اینٹی باڈیز SARS-CoV-2 کی تمام ماضی اور موجودہ مختلف حالتوں کو پہچانتی ہیں اور ان کو پابند کرتی ہیں۔
اگرچہ متعدد تشخیصی اینٹی باڈیز N پروٹین کے ایک ہی خطے کو پہچانتی ہیں، محققین نے پایا کہ ہر اینٹی باڈی میں فرار کی تبدیلیوں کی منفرد علامت ہوتی ہے۔جیسا کہ SARS-CoV-2 وائرس مسلسل بدلتا رہتا ہے اور نئی شکلیں پیدا کرتا ہے، اس ڈیٹا کو فلیگ ٹیسٹ کٹ اینٹی باڈیز کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے جن کا دوبارہ جائزہ لینے کی ضرورت ہو سکتی ہے۔
Ortlund نے کہا، "متاثرہ افراد کی درست اور موثر شناخت COVID-19 کی تخفیف کے لیے ایک اہم حکمت عملی بنی ہوئی ہے، اور ہمارا مطالعہ مستقبل کے SARS-CoV-2 کے تغیرات کے بارے میں معلومات فراہم کرتا ہے جو پتہ لگانے میں مداخلت کر سکتے ہیں۔""یہاں بیان کردہ نتائج ہمیں اس وائرس کے ساتھ تیزی سے اپنانے کی اجازت دیتے ہیں کیونکہ نئی قسمیں ابھرتی رہتی ہیں، فوری طبی اور صحت عامہ کے مضمرات پیش کرتی ہیں۔"
پس منظر: اتپریورتن ڈیپ اسکین SARS-CoV-2 نیوکلیوکاپسڈ میں فی الحال دستیاب تیز رفتار اینٹیجن ٹیسٹوں کا استعمال کرتے ہوئے فرار ہونے والے تغیرات کا پتہ لگاتا ہے۔فرینک F.، Kin MM، Rao A.، Bassit L.، Liu H، Bowers HB، Patel AB، Kato ML، Sullivan JA، Greenleaf M.، Piantadosi A.، Lam VA، Hudson VH، Ortlund EA سیل۔2022 ستمبر 15؛ 185(19):3603-3616.e13۔وزارت داخلہ: 10.1016/j.cell.2022.08.010۔29 اگست 2022 PMID: 36084631۔
فنڈنگ: نیشنل انسٹی ٹیوٹ فار بایومیڈیکل امیجنگ اینڈ بائیو انجینئرنگ NIH (NIBIB)، نیشنل انسٹی ٹیوٹ آف ذیابیطس، ڈائجسٹو اینڈ کڈنی ڈیزیز (NIDDK) اور نیشنل انسٹی ٹیوٹ آف الرجی اینڈ انفیکٹو ڈیزیز (NIAID)، امریکن ہارٹ ایسوسی ایشن۔
NIH ریسرچ میٹرز کلیدی NIH تحقیقی نتائج کا ہفتہ وار اپ ڈیٹ ہے جس کا NIH ماہرین نے جائزہ لیا ہے۔یہ نیشنل انسٹی ٹیوٹ آف ہیلتھ کے ڈائریکٹر کے مواصلات اور عوامی امور کے دفتر نے شائع کیا ہے۔